Adaboğazı, tarihi boyunca pek çok medeniyete ev sahipliği yapmış, köklü bir geçmişe sahip bir bölgedir. MÖ 4000’li yıllara kadar uzanan bu coğrafya, farklı kültürlerin izlerini taşır. Minoslar, Karyalılar, Dorlar ve İyonlar gibi çeşitli topluluklar, bu topraklar üzerinde yaşamış ve her biri kendi izlerini bırakmıştır. Zamanla Roma ve Bizans egemenliğine giren Adaboğazı, Selçuklu ve Osmanlı dönemlerinde de önemli bir yerleşim yeri olmuştur.

Adaboğazı'nın tarihi hakkında şu bilgiler verilebilir:

• MÖ 4000’li yıllara dayanan geçmişi ile Adaboğazı, tarih boyunca çok fazla medeniyetin ayak bastığı bölgeler arasındadır.
• MÖ 3000’li yıllarda belde topraklarında Minos hakimiyeti başlamış, daha sonra topluluk Karyalılar olarak anılmıştır.
• MÖ 1000’li yıllarda Dor ve İyonların istilası bölgede karışıklığa neden olmuş ve bu durum Karyalılar’ın bölgeyi terk etmek zorunda kalmasına yol açmıştır.
• Şehir, MÖ 120 yılında Romalıların eline geçmiş, MS 395 yılında ise Adaboğazı, Bizans topraklarının bir parçası olmuştur.
• 1. yüzyılda Selçukluların yönetimine geçen Adaboğazı, 14. yüzyıldan itibaren Osmanlı hakimiyeti altında yer almıştır.
• Geçmişte bölgeye başlayan Türkmenlerin gelişi, Cumhuriyet döneminde mübadele sonrası daha da hızlanarak devam etmiştir.

Ayrıca, Adaboğazı'nın eski adı, Bodrum'daki Akvaryum Koyu'dur.