Aizanoi Antik Kenti'ndeki Zeus Tapınağı, tarih boyunca birçok faktör sayesinde günümüze kadar ulaşmayı başarmıştır. Bu korunma sürecinde coğrafi koşulların yanı sıra, bilimsel kazı ve restorasyon çalışmaları da büyük rol oynamıştır. Tapınağın mimari yapısı ve üzerindeki yazıtlar, hem tarihi önemini artırmış hem de koruma çalışmalarına ışık tutmuştur. Tüm bu etkenler, Zeus Tapınağı'nın özgünlüğünü ve değerini korumasını sağlamıştır.

Aizanoi Antik Kenti'ndeki Zeus Tapınağı'nın korunmasında birkaç etken rol oynamıştır:

• Coğrafi konum: İç Ege'nin ıssız yapısı, büyük çaplı taş sökme faaliyetlerini sınırlamış ve bu sayede tapınak, önemli ölçüde orijinal haliyle korunmuştur.
• Kazı ve koruma çalışmaları: Tapınak, 1926 yılından bu yana Alman Arkeoloji Enstitüsü tarafından düzenli olarak kazılmakta ve korunmaktadır.
• Özgünlük ve bütünlük: Roma döneminin baskın varlığı, tapınağın mimari bütünlüğünü ve özgün yapısını daha kolay korunabilir kılmıştır.
• Yazıtlar ve belgeler: Tapınağın duvarlarında yer alan Yunanca ve Latince yazıtlar, yapının tarihi ve kullanımı hakkında önemli bilgiler sunmakta ve koruma çalışmalarına rehberlik etmektedir.

Zeus Tapınağı, bu sayede Anadolu'daki en iyi korunmuş Roma dönemi tapınaklarından biri olarak kabul edilmektedir.